従来からある医療費控除は、年間10万円以上（総所得金額が２００万円未満の場合はその金額の５％）を支払った場合にその超える金額（最高200万円）まで控除できる制度です。

一方で、新しく医療費控除の特例として平成33年12月末までで、「セルフメディケーション税制」が施行されました。

この制度は健康の推進及び疾病の予防への一定の取組（特定健康診査、予防接種、定期健康診断、健康検査、がん検診）を行う納税者が、セルフメディケーション税制の条件に該当する医薬品を購入した場合に所得税や住民税の所得控除を受けられる制度です。

１．セルフメディケーション税制と医療費控除は併用はできずどちらか一方のみ選択可能

すなわち以下のそれぞれの限度額を計算し、有利なほうを選択していけばよいことになります。